Embrio pendirian Fakultas Pertanian dimulai pada tahun 1968 dengan merencanakan pendirian Fakultas Pertanian dan Kehutanan di Kuala Kapuas. Namun embrio tersebut baru bisa tumbuh ketika didirikannya Fakultas Non Gelar Teknologi (FNT) pada tahun 1981. Dalam rangka menindaklanjuti Peraturan Pemerintah Nomor 30 Tahun 1990 tentang Pendidikan Tinggi serta Keppres RI Nomor 10 Tahun 1991 tentang Susunan Organisasi Universitas/ Institut Negeri, diantaranya mengatur tentang pengintegrasian Fakultas Non Gelar Teknologi (FNT) ke dalam Fakultas dengan disiplin ilmu yang sama dalam suatu Universitas/Institut Negeri, maka diterbitkan Surat Keputusan Rektor Universitas Palangka Raya Nomor 583/PT31.H/C/VI/91 tanggal 2 Mei 1991 tentang Penutupan dan Pengintegrasian Fakultas Non Gelar Teknologi Universitas Palangka Raya, dan sekaligus membentuk Tim Pengelola Program Strata 1 Ilmu-ilmu Pertanian menjadi Fakultas Pertanian Universitas Palangka Raya. Perkembangan selanjutnya adalah Pembentukan Program Studi Sosial Ekonomi Pertanian di Universitas Palangka Raya berdasarkan Surat Keputusan Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi Depdikbud RI Nomor 280/Dikti/Kep/93 tanggal 10 Mei 1993.
Fakultas Pertanian Universitas Palangka Raya dikukuhkan dengan Surat Keputusan Mendikbud Nomor 0368/O/1993 tanggal 21 Oktober 1993. Saat ini Fakultas Pertanian memiliki 4 Jurusan dengan 8 program studi didalamnya. Dari 8 Program Studi tersebut 7 diantaranya telah terakreditasi “B”, selanjutnya sebagai Prodi bungsu di Fakultas Pertanian adalah Teknologi Industri Pertanian yang akan di Asesmen pada tanggal 10 dan 11 Agustus 2020 mendatang.
Berikut Kondisi Akreditasi Program Studi pada tahun 2019
| No. | Program Studi | Tanggal Petapan | Akreditasi | Tanggal Kdaluarsa |
| 1. | Agroteknologi | 29-12-2015 | B | 29-12-2020 |
| 2. | Kehutanan | 20-04-2016 | B | 20-04-2021 |
| 3. | Agribisnis | 10-06-2017 | B | 10-06-2021 |
| 4. | MSP | 18-08-2016 | B | 18-08-2021 |
| 5. | Budidaya Perairan | 20-10-2016 | B | 20-12-2021 |
| 6. | Peternakan | 12-12-2018 | B | 12-12-2023 |
| 7. | THP | 09–07-2019 | B | 09-07-2024 |
| 8. | TIP | Asesmen |
Berbagai persiapan oleh Tim Asesmen UPPS dan Tim Penyusun Dokumen Akreditasi Prodi untuk kegiatan Asesmen oleh Tim Asesor BAN-PT untuk menentukan Akreditasi terhadap Prodi TIP tersebut, sehingga Lulusan Pertamanya Nanti sudah menyandang Sarjana Teknologi Pertanian dan Terakreditasi, dan kedepannya Pengguna dapat memanfaatkan Lulusan dari prodi ini dengan baik dan produktif.
